Finally, the Egyptian ?? National Research Center (NRC) started #sequencing the #genome ? of #coronavirus (SARS-CoV-2) from Egyptian patients and making them public ??? So far there are two virus ? genomes from Egypt that are publicly available.
I pulled the public sequence data and did a quick phylogenetic ? analysis to include those two Egyptian samples: it does not seem there is anything special about them. One sample is clearly very close to a sample from Saudi Arabia ??.
The other sample is generally similar to samples from Europe ??, and maybe specifically from France.
Acknowledgment: The sequence data was obtained from GISAID
يقوم المركز القومي للبحوث المصرية بجهد متميز لوصف العناصر الوراثية للفيروس التاجي المعزول من المرضى المصريين.
Acknowledgment: The sequence data was obtained from GISAID
يقوم المركز القومي للبحوث المصرية بجهد متميز لوصف العناصر الوراثية للفيروس التاجي المعزول من المرضى المصريين.
جعل مركز البحوث الوطني هذه البيانات الجينية متاحة للجمهور. يمكن أن يساعد إنشاء هذه البيانات وتوافرها في معرفة ما إذا كانت هناك أنواع فرعية / سلالات من الفيروس خاصة ببلدان أو مجموعات سكانية مختلفة. يمكننا أيضًا معرفة حركة الفيروس وانتقاله ، مكانيًا وزمنيًا ، كيف /
متى ينتقل الفيروس من بلد إلى آخر. كما أنه يساعد على معرفة بنية بروتينات الفيروس التي يمكن أن تساعد في تصميم الأدوية التي تستهدف الفيروس.
نظرًا لتوفر البيانات ، تمكنت من تنزيل العينات المصرية وإجراء تحليل للتطور الوراثي الذي يمكنه الكشف عن العلاقات بين العينات الفيروسية المصرية
نظرًا لتوفر البيانات ، تمكنت من تنزيل العينات المصرية وإجراء تحليل للتطور الوراثي الذي يمكنه الكشف عن العلاقات بين العينات الفيروسية المصرية
والعينات التي تم جمعها من مرضى مختلفين في مواقع مختلفة في نقاط زمنية مختلفة. في شجرة السلالات الناتجة ، يمكننا أن نرى أن عينة مصرية هي الأقرب إلى عينة من المملكة العربية السعودية مما يشير إلى سفر شخص مصاب بين البلدين ونشر الفيروس من دولة إلى أخرى. أيضا
ترتبط العينة المصرية الأخرى ارتباطًا وثيقًا بمجموعة من العينات من أوروبا.
مع توفر المزيد من البيانات ، سيكون لدينا فهم أفضل حول انتقال الفيروس وجينات الفيروس و تفاعلها مع الخلية البشرية.
نقلا عن د. احمد مصطفي
معمل الفيروسات بمركز التميز العلمي بالمركز القومي للبحوث
مع توفر المزيد من البيانات ، سيكون لدينا فهم أفضل حول انتقال الفيروس وجينات الفيروس و تفاعلها مع الخلية البشرية.
نقلا عن د. احمد مصطفي
معمل الفيروسات بمركز التميز العلمي بالمركز القومي للبحوث
Loading suggestions...