موضوعنا اليوم مهم وجميل عن Bioinformatics 🧬🧮🖥
اول حاجة نحتاج نعرف Bioinformatics ✨
هي معلومات حيوية استخدموا فيها عدة تقنيات مثل الرياضيات والإحصاء وايضا علم الحاسوب لعمل مرجع لهذه المعلومات الحيوية 🧬👌🏼🧮🖥
المرجع هذا يفيدنا في المجال الطبي والبحثي بشكل جداا كبير 👌🏼✨
هي معلومات حيوية استخدموا فيها عدة تقنيات مثل الرياضيات والإحصاء وايضا علم الحاسوب لعمل مرجع لهذه المعلومات الحيوية 🧬👌🏼🧮🖥
المرجع هذا يفيدنا في المجال الطبي والبحثي بشكل جداا كبير 👌🏼✨
A-Bioinformatics application تطبيقات المستخدمة ✨🧪🧬🦠💊🖥
1-Sequence analysis
2-Prediction of protein structure
3-Genome annotation
4-Drug discovery
5-Antibiotic resistance
1-Sequence analysis
2-Prediction of protein structure
3-Genome annotation
4-Drug discovery
5-Antibiotic resistance
B-Bioinformatics software
البرامج او المواقع المستخدمة وراح نطبق مع بعض بعض البرامج 😍✨👌🏼
1-NCBI
2-Ensembl
3-dbSNP
4-Mfold
البرامج او المواقع المستخدمة وراح نطبق مع بعض بعض البرامج 😍✨👌🏼
1-NCBI
2-Ensembl
3-dbSNP
4-Mfold
اول موقع راح يكون NCBI ✨🧬
هذا الموقع يعتبر كنز ماتتخيلوا الكم الهائل من المعلومات الموجودة فيه😎
راح نطلع السلسلة الجينية للبكتيريا او الفيروس (مايكرو)👍🏻😍
١-الخطوة الاولى افتحوا الموقع واختارو Nucleotide🧬✨
٢-اكتبوا اسم البكتيريا او الفيروس في البحث راح تطلع معاكم مجموعة👌🏼✨
هذا الموقع يعتبر كنز ماتتخيلوا الكم الهائل من المعلومات الموجودة فيه😎
راح نطلع السلسلة الجينية للبكتيريا او الفيروس (مايكرو)👍🏻😍
١-الخطوة الاولى افتحوا الموقع واختارو Nucleotide🧬✨
٢-اكتبوا اسم البكتيريا او الفيروس في البحث راح تطلع معاكم مجموعة👌🏼✨
٣-في البحث ممكن تبحث عن التسلسل الجيني لجين معين في البكتيريا وممكن تبحث عن التسلسل الجيني لكل الجينات في البكتيريا اذا كنت تحتاج جين معين اكتب الجين في البحث وراح يطلع لك 👌🏼✨
٤-راح نحدد النتائج بشكل ادق لبكتيريا الي نبغاها نختار البكتيريا حقتنا داخل الدائرة في الصورة 👍🏻✨
٤-راح نحدد النتائج بشكل ادق لبكتيريا الي نبغاها نختار البكتيريا حقتنا داخل الدائرة في الصورة 👍🏻✨
٥-راح اضيف في البحث ampc جين مهم في البكتيريا وهو المسؤول عن مقاومتها للمضادات الحيوية💊❌
٦-ونعمل البحث + احدد الاختيار بشكل دقيق + اختار الي اجد فيه المطلوب👍🏻✨
٧-تنفتح لنا صفحة في اول الصفحة في كلمة send to نضغط عليها نختار
create file+Coding sequence
٨-راح تنحفط عندنا👍🏻😍
٦-ونعمل البحث + احدد الاختيار بشكل دقيق + اختار الي اجد فيه المطلوب👍🏻✨
٧-تنفتح لنا صفحة في اول الصفحة في كلمة send to نضغط عليها نختار
create file+Coding sequence
٨-راح تنحفط عندنا👍🏻😍
الطريقة الثانية هي Blast بهذه الطريقة نقدر نقارن بين سلسلة جينية واخرى وممكن نشوف السلسلة الجينية حقتنا وتتشابه مع ايت سلسلة 😍👌🏼🧬✨
على حسب السلسلة الي عندك اذا كانت DNA او RNA راح نختار Nucleotide لكن اذا كانت Amino acid راح نختار بروتين 👌🏼✨
على حسب السلسلة الي عندك اذا كانت DNA او RNA راح نختار Nucleotide لكن اذا كانت Amino acid راح نختار بروتين 👌🏼✨
١-نختار Nucleotide ✨
٢-عندنا خيارين ممكن ننسخ السلسلة الجينية حقتنا الي حفظنها في الخطوة السابقة من NCBI وألصقها في المربع الأبيض وممكن احط الملف بالكامل وهذه من وجهة نظري افضل👍🏻✨😍
٣-اضغط على كلمة Blast في الاسفل👌🏼✨
٢-عندنا خيارين ممكن ننسخ السلسلة الجينية حقتنا الي حفظنها في الخطوة السابقة من NCBI وألصقها في المربع الأبيض وممكن احط الملف بالكامل وهذه من وجهة نظري افضل👍🏻✨😍
٣-اضغط على كلمة Blast في الاسفل👌🏼✨
٤- راح تفتح معانا هذه الصفحة فيها معلومات عن السلسلة الجينية حقتنا والمتشابه معاها من تسلسل جيني اخر ونسبة التشابه والاختلاف وايضا اذا كان في Gap او Mismatched كل هذه المعلومات ممكن نلاقيها هنا 👍🏻😍
٥ - نقدر نختار اي سلسلة جينية وعادة نهتم بالاكثر تشابه وهي اول وحدة تشابه بينهم ۱۰۰٪
٦ - نختار قسم alignments وهنا نقدر نشوف gap و mismatched✨👍🏻
٧ - راح نلاحظ اول واحد مافيه اي اختلاف لكن ثاني واحد فيه 6 gap وهنا نلاقي الاختلاف بينهم كان في 6 لانها المفروض تكون ۱۱۱۹ هي ۱١۱۰✨
٦ - نختار قسم alignments وهنا نقدر نشوف gap و mismatched✨👍🏻
٧ - راح نلاحظ اول واحد مافيه اي اختلاف لكن ثاني واحد فيه 6 gap وهنا نلاقي الاختلاف بينهم كان في 6 لانها المفروض تكون ۱۱۱۹ هي ۱١۱۰✨
۸ - في هذه السلسلة في غير gap في Mismatched وبكذا سارت ۱۱۰۹ ومكانه داخل الدائرة ( C / T )👌🏼😍✨
٩ لو بنقارن بين سلسلتين جينية كيف راح نقارن 🤔✨
بنفس الموقع بس بدل مانحط سلسلة وحدة راح نحطهم الاثنين ونضغط Blast 👌🏼✨
١-اضغط على align tow or more sequences
٢-حط الاثنين + اضغط على Blast
بنفس الموقع بس بدل مانحط سلسلة وحدة راح نحطهم الاثنين ونضغط Blast 👌🏼✨
١-اضغط على align tow or more sequences
٢-حط الاثنين + اضغط على Blast
٣- طلع التشابة بينهم بنسبة ٩٨.٨٣٪
٤-ونقدر نشوف انوا بينهم ٦ gap وعدد كبير من Mismatched 👍🏻😍✨
٤-ونقدر نشوف انوا بينهم ٦ gap وعدد كبير من Mismatched 👍🏻😍✨
نكتفي اليوم بهذه التطبيقين جربوهم وصورا وأرسلوا لي النتائج 😍🌸✨
وبكره باذن الله نكمل التطبيقات الثانية وراح نخرج بروتينات كورونا فيروس الثلاثة الانواع ونقارن بينهم كونوا مستعدين 😍🙏🏻
وبكره باذن الله نكمل التطبيقات الثانية وراح نخرج بروتينات كورونا فيروس الثلاثة الانواع ونقارن بينهم كونوا مستعدين 😍🙏🏻
Loading suggestions...